采购药品，验收入库后，由保管将发票与入库单一同交会计进行审核，核查、计算无误，以上月盘存日至本月盘存日为循环周期，按供货单位分西药、中成药、中草药进行分类汇总，填制药品汇总表：
借：药品——药库药品
贷：应付账款——某医药公司
贷：药品进销差价
付款时，会计根据核对无误发票与入库单：
借：应付账款——某医药公司
贷：银行存款
保管将每个循环周期内的出库单交会计审核，核算无误，按不同药房和领用部门分类汇总，填制药品出库汇总表：
其中：药房领药：
借：药品——药房药品
贷：药品——药库药品
临床科室领药：
借：药品成本——商品和劳务支出——专用材料
借：药品进销差价
贷：药品——药库药品
会计根据由专人统计的药品处方消耗统计，审核无误，计算药品综合差价率、结转药品销售成本，药品定价按规定是在药品购进单价的基础上加成15%，有特殊规定如：购进单价在500元以上的药品只能加价75元，诺和笔、针头在购进单价的基础上只加成5%。利用药品综合差价率计算、结转药品销售成本，能全面、综合、接近实际地反映医院药品流动情况：
药品综合差价率=（药品进销差价期初余额%2B本期药品进销差价贷方发生额）/(药品期初余额%2B本期药品借方发生额) ×100%
药品销售成本=当期药品销售额×(1-综合差价率)
借：药品成本——商品和劳务支出——专用材料
借：药品进销差价
贷：药品——药房药品
药剂科根据调价文件，清点调价药品的库存数量，编制“x 年x 月x 日药品调价明细统计汇总表”一式三份，调整药库、药房药品库存，会计调账：
药品价格上调：
借：药品
贷：药品进销差价
药品价格下调：
借：药品进销差价
贷：药品
因为调价造成的损失，由供货单位根据“x 年x 月x 日药品调价明细统计汇总表”针对单个药品开具调价冲票，会计根据调价冲票和“x 年x 月x 日药品调价明细统计汇总表”进行账务处理：
借：应付账款——某供货单位
贷：药品进销差价